なんてことはない、フォーマットのローダー部分。
ふつうは、マスターブートレコードＭＢＲを選ぶけど、これだと３ＴＢまでしか認識できないです。そこで４ＴＢ以上を認識させるにはＧＵＩＤパーティションを選びます。
ウインドウズもマックも同じです。MacOSXであれば10.5インテルからGUID専用になってますね。ウインドウズではＸＰでＧＵＩＤを使うと、認証できないハードディスクもありますので、ちょっと事前に検査しておく必要があります。ウインドウズ８や７では、ＧＵＩＤが基本なので、特に迷うことは無いと思いますが、今使っているウインドウズ７がＸＰ時代からのアップグレードであれば４ＴＢを認識できない、という問題に直面するかもしれません。（この記事をご参考に）